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铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGP)基因的密码子偏好分析

2019-11-07 08:27:09   来源:365bet足球直播   作者:365bet手机版中文   【 评论:
铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGP)基因的密码子偏好分析
孙静何涛万兰兰彭晓峰于泽
描述:UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)是葡萄糖代谢的主要酶之一。
为了解尿苷尿苷二磷酸铁皮石斛(UGP),D.D。的密码子使用特征,使用在线程序CHIPS,CUSP和CodonW(访问号)。分析了白色念珠菌UGP基因。GenBank:KF 711982)。
1)密码子偏好和UGP基因与其他物种的基因组的比较。
结果表明,铁皮石斛的UDP基因优选以A / T结尾的密码子,27个优选密码子(RSCU1)中的TAA和CCU(RSCU≥2)。
已经发现,与其他物种中UGP基因的密码子使用频率相比,不同物种中UGP基因的密码子使用偏好存在一些差异。
在9个选定物种的聚类分析中,发现基于UDP基因的CDS序列聚类的系统发育树比基于RSCU的聚类更接近传统的系统发育观点。
与三种生物基因组的密码子使用相比,我们发现大肠杆菌基因组的密码子使用与酵母和拟南芥基因组的13种密码子使用之间存在23种差异。我找到了。铁皮石斛Ugn基因在裂殖酵母和拟南芥中的表达效率高|文献信息| J-GLOBAL
本研究结果为临床研究铁皮石斛UDP基因最佳外源表达系统的选择及其表达水平的提高奠定了基础。
作者单位:
中国科学院中国科学院成都生物研究所,[基金]:国家科技支撑计划(2011BAC09B04)
中国科学院知识创新项目与校园合作项目(XBCD-2011-007)
四川中药改良项目“十二年”(2011 NZ 0098-12-10)
四川省应用基础研究与科学技术支持计划(2013 JY 0133,2014 JY 0179,2014 FZ 0086)
四川省科技基础条件平台项目融资~~[类别编号]:Q943。
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